2016至2018年，福建省共有1823家企业进入“科技小巨人领军企业培育发展库”进行培育，其中福厦泉三地总数达1264家、占总数比例为69.3%。各地科技小巨人领军企业培育数量有福州329家、厦门442家、漳州130家、泉州493家、三明108家、莆田69家、南平78家、龙岩99家、宁德73家、平潭2家。

为鼓励科技小巨人领军企业加大研发投入，福建省设立科技小巨人领军企业研发费用加计扣除奖励资金，2016至2018年共对736家企业共奖励33415.5万，带动企业研发费用投入达44.27亿元，带动比例达到13.2倍。福建省科技厅通过多种渠道向科技小巨人领军企业广泛宣传扶持政策，2016至2018年，加大对科技小巨人领军企业支持省科技计划项目343项资金23472万元，省级科技创新券补助科技小巨人领军企业554家资金3992万元。